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细菌识别技术

技术来源:牛津大学 ISIS 项目编号:07895 发布时间:2015-08-18  

  用于快速和精确的细菌分类的数据库和方案,可应用于疾病诊断

  通用的基于基因的识别

  高分辨率的细菌特征描述是微生物学的根本,尤其在疾病诊断方面,关键是快速和精准的识别。基于基因的方法已经在细菌分类方面越来越重要,补充了,甚至在某种程度上替代了传统的表型的方法。但是,至今还没有一种系统能够识别所有的细菌。

  牛津大学的科学家发明了一种通用的基于核糖体的多位点序列分型(rMLST)的细菌识别方案。该发明是第一种能够在所有系统发育水平上广泛和精确细菌特征化的基因型方案。该系统通过识别和分析在核糖体蛋白亚族(rps)基因内的等位变异去达到快速和高精确度的系统发育的识别;该基因具有通用性,还记录了大范围的进化差异性。

  整个细菌领域的各群体相连接树,通过对串级核糖体蛋白基因序列重建而得

  Neighbour-joining tree of the entire bacterial domain, reconstructed from concatenated ribosomal protein gene sequences.

  牛津大学技术优势

  可靠的识别

  高分辨率

  按键操作,结果易得

  一套系统可用于所有细菌

  支持数据

  一套支持网络获取和可拓展的数据库包含了从超过2000细菌菌株的基因组数据。该数据库分类记录了53个核糖体蛋白亚族基因的变种,提供了一种在界门纲目科属种和血缘层次上定义所有细菌序列精确的系统发育位置的方法。

  应用前景

  为核糖体的多位点序列分型方案产生的数据能够用来和下一代序列一起去实现细菌菌株的快速识别,只需按一下按钮。同样的,该数据库能够支持开发基于聚合酶链反应的,种或者血缘层次上的诊断测试。

  应用包括:

  人口研究

  流行病调查

  诊断测试

  知识产权现状

  该技术具有软件和数据库版权保护。

  Isis科技创新很乐意与对开发这种新系统感兴趣的企业和投资者进行交流。

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